Mootorfänntöötab elektrimootori abil, et pöörata terade või labade seeriat, mis seejärel õhku ruumis ringlevad. Elektrimootori jõuallikaks on elekter, mis mootoris olevate magnetväljade vastasmõjul muudetakse pöörlemisenergiaks.
Kui elekter liigub läbi mootori poolide, tekitab see magnetvälja, mis interakteerub mootori püsimagnetite magnetväljaga, põhjustades mootori rootori (mootori pöörleva osa) pöörlemise. Seejärel kantakse see pöörlemisenergia üle ventilaatori labadele, mis pöörlevad ja tekitavad õhuvoolu.
Ventilaatori labad on tavaliselt konstrueeritud kumera kujuga, mis võimaldab neil õhku tõhusamalt liigutada. Labade pöörlemisel tekib nende taha madalrõhuala, mis tõmbab õhku ventilaatorisse. Seejärel lükatakse see õhk edasi ja ventilaatorist välja, luues õhuvoolu, mis võib aidata ruumi jahutada või masinast soojust hajutada.
Ventilaatori labade pöörlemiskiirust juhitakse tavaliselt kiiruse regulaatori või takistite seeriaga, mis reguleerivad mootorile antava elektrienergia kogust. See võimaldab ventilaatoril töötada erinevatel kiirustel, olenevalt kasutaja vajadustest või jahutatava ruumi temperatuurist.